咖啡樹是植物學中一種多年生的常綠雙子葉灌木,其野生種之樹高約10公尺,但是一般大量栽培之咖啡樹的樹高僅約2~3公尺,以維持適當的樹狀並利於采收; 咖啡樹的樹枝對立生長,呈水平或下垂分枝生長,其樹葉則對生於短莖分枝上;Arabica種的樹葉長約15公分,Robusta種的樹葉較長,呈卵形或尖 槍形,其顏色為亮綠色。

        咖啡樹的第一次花期約在樹齡3年-4年時,花呈乳白色且具有香甜的花香,其花冠長約20毫米,上部分裂成8個花瓣。在咖啡花凋謝以後,慢慢形成長約18毫 米,直徑為10~15毫米的卵形果實,最初呈綠色,熟成以後冉呈紅色,此果實即可采收,一般稱為Cherry。咖啡果實內含有兩顆咖啡豆,也是咖啡樹的種 籽,這兩顆咖啡豆各以其平面,面對直立在果實內,各個咖啡豆都為一層薄的外膜所包覆,此膜稱為Silverskin,其外層又被覆一層黃色外皮,稱為 Parchment,整個咖啡豆則包裹於黏質漿狀物中,形成咖啡的果肉,最外層則為外殼。